Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms