Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms