Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF9Q00978 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms