Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms