Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP1Q00587 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms