Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD1P98174 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD1P98174 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD1P98174 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD1P98174 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD1P98174 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD1P98174 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FGD1P98174 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD1P98174 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD1P98174 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD1P98174 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD1P98174 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms