Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX6P78412 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX6P78412 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX6P78412 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX6P78412 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX6P78412 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX6P78412 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX6P78412 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IRX6P78412 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IRX6P78412 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IRX6P78412 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IRX6P78412 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX6P78412 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX6P78412 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX6P78412 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX6P78412 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX6P78412 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX6P78412 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX6P78412 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX6P78412 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX6P78412 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX6P78412 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms