Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEP78395 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms