Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT83P78385 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT83P78385 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT83P78385 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT83P78385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT83P78385 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT83P78385 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT83P78385 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT83P78385 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT83P78385 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT83P78385 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT83P78385 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT83P78385 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms