Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms