Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HBBP68871 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HBBP68871 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HBBP68871 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HBBP68871 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HBBP68871 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HBBP68871 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HBBP68871 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms