Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL23AP62750 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms