Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPD3P62318 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNRPD3P62318 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPD3P62318 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms