Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms