Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHBDL3P58872 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms