Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBEYP58557 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBEYP58557 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBEYP58557 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YBEYP58557 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBEYP58557 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms