Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSX2P58304 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSX2P58304 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSX2P58304 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSX2P58304 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSX2P58304 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSX2P58304 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VSX2P58304 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSX2P58304 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSX2P58304 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms