Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EEFSECP57772 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EEFSECP57772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEFSECP57772 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEFSECP57772 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEFSECP57772 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEFSECP57772 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEFSECP57772 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEFSECP57772 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEFSECP57772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms