Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX16P57768 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX16P57768 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX16P57768 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX16P57768 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX16P57768 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX16P57768 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX16P57768 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX16P57768 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms