Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN8P56748 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN8P56748 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN8P56748 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN8P56748 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN8P56748 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN8P56748 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms