Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL23P55773 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL23P55773 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL23P55773 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL23P55773 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL23P55773 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCL23P55773 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCL23P55773 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCL23P55773 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL23P55773 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms