Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH8P55286 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH8P55286 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH8P55286 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH8P55286 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH8P55286 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH8P55286 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH8P55286 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH8P55286 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH8P55286 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH8P55286 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms