Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms