Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms