Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms