Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK2P53671 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms