Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK1P53667 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIMK1P53667 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 371.3 ms