Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX1P52954 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LBX1P52954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LBX1P52954 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LBX1P52954 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LBX1P52954 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LBX1P52954 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LBX1P52954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LBX1P52954 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX1P52954 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX1P52954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX1P52954 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms