Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP7P51809 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms