Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR5P51681 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR5P51681 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR5P51681 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR5P51681 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR5P51681 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms