Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRP3P50461 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms