Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFBP49765 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VEGFBP49765 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms