Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms