Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NESP48681 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NESP48681 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NESP48681 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NESP48681 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NESP48681 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NESP48681 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NESP48681 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NESP48681 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NESP48681 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
NESP48681 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NESP48681 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NESP48681 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NESP48681 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NESP48681 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NESP48681 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NESP48681 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NESP48681 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
NESP48681 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
NESP48681 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NESP48681 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NESP48681 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NESP48681 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NESP48681 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NESP48681 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
NESP48681 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
NESP48681 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NESP48681 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NESP48681 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NESP48681 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NESP48681 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NESP48681 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NESP48681 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NESP48681 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NESP48681 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NESP48681 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NESP48681 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NESP48681 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NESP48681 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NESP48681 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NESP48681 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NESP48681 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NESP48681 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NESP48681 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NESP48681 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NESP48681 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NESP48681 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NESP48681 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NESP48681 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
NESP48681 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
NESP48681 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms