Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT6CP48668 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms