Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR4P46093 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR4P46093 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR4P46093 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR4P46093 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR4P46093 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms