Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA4P43681 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA4P43681 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms