Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGER2P43116 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms