Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSG1P42857 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSG1P42857 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSG1P42857 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSG1P42857 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSG1P42857 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSG1P42857 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSG1P42857 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSG1P42857 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms