Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA2P42765 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms