Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP2P42575 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP2P42575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP2P42575 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP2P42575 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms