Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH1P40692 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH1P40692 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH1P40692 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH1P40692 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH1P40692 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH1P40692 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH1P40692 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH1P40692 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms