Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4AP40617 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms