Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEACAM3P40198 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms