Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK1P39086 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK1P39086 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms