Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAL1P37235 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAL1P37235 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAL1P37235 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAL1P37235 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAL1P37235 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAL1P37235 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms