Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBRP36941 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBRP36941 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBRP36941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBRP36941 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBRP36941 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBRP36941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBRP36941 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBRP36941 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBRP36941 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBRP36941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBRP36941 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms