Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT2P35908 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT2P35908 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT2P35908 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT2P35908 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT2P35908 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT2P35908 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT2P35908 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT2P35908 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT2P35908 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT2P35908 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT2P35908 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT2P35908 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT2P35908 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT2P35908 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms