Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPB2P35606 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COPB2P35606 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPB2P35606 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPB2P35606 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPB2P35606 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPB2P35606 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms