Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RORAP35398 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RORAP35398 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORAP35398 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORAP35398 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORAP35398 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORAP35398 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORAP35398 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORAP35398 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms